Το Τμήμα Μεταφορών, Υποδομών και Εναλλακτικών Καυσίμων του ΚΑΠΕ προσφέρει υποστηρικτικές υπηρεσίες σε Οργανισμούς Τοπικής Αυτοδιοίκησης και λοιπούς φορείς προκειμένου να ενισχύσουν τις βιώσιμες αστικές μετακινήσεις και να βελτιώσουν το περιβαλλοντικό τους αποτύπωμα.

• Σεμινάρια εκμάθησης των τεχνικών του Ecodriving (Οικονομική, Οικολογική και Ασφαλής Οδήγηση). Κατά το παρελθόν, το ΚΑΠΕ έχει εκπαιδεύσει το προσωπικό οργανισμών, όπως ο ΗΛΠΑΠ, ΟΣΥ, ΔΕΗ, αλλά και μεγάλων ιδιωτικών εταιρειών, προκειμένου να βελτιώσουν το περιβαλλοντικό τους προφίλ.
• Αποτίμηση ωφελειών δράσεων βιώσιμης αστικής κινητικότητας. Το ΚΑΠΕ συντονίζει το καινοτόμο για την Ελλάδα έργο «Βιώσιμη Αστική Κινητικότητα, Μικροκινητικότητα, Ολοκληρωμένη Διαχείριση Αστικών Μετακινήσεων» και υποστηρίζει 111 Δήμους για την ανάπτυξη συστημάτων κοινόχρηστων ηλεκτρικών ποδηλάτων. Παράλληλα, έχει δημιουργήσει πλατφόρμα παρακολούθησης και επεξεργασίας των αποτελεσμάτων και δεδομένων του έργου προκειμένου να προτείνει στους Δήμους και την Πολιτεία σημεία για την τοποθέτηση νέων σταθμών φόρτισης, αλλά και νέες διαδρομές με ποδηλατοδρόμους.
• Green Logistics. Το ΚΑΠΕ, μέσα από την εμπειρία του σε Ευρωπαϊκά έργα όπως το FLEAT, Interaction, GARDEN, συμβουλεύει και υποστηρίζει οργανισμούς και εταιρείες με στόλους οχημάτων για τη βέλτιστη διαχείριση με σκοπό την ενίσχυση του περιβαλλοντικού προφίλ τους και του κόστους λειτουργίας.
• Εναλλακτικά καύσιμα. Το ΚΑΠΕ παρακολουθεί τις σχετικές τεχνολογίες και εξελίξεις και συμμετέχει σε ομάδες πιστοποίησης εξοπλισμού και εργασιών έργων παραγωγής υδρογόνου και άλλων εναλλακτικών καυσίμων.